HUAWEI nova Y90 базируется на базе 6-нм восьмиядерного процессора Qualcomm Snapdragon 680 с тактовой частотой до 2,4 ГГц и графическим ускорителем Adreno 610. Объём оперативной памяти равен 4 Гбайт, ёмкость флеш-накопителя — 128 Гбайт.
Смартфон оснащён большим 6,7-дюймовым безрамочным IPS-дисплеем HUAWEI FullView с разрешением Full HD+ (2388 × 1080 пикселей). Частота обновления экрана составляет до 90 Гц, частота дискретизации касания — 270 Гц. Благодаря сверхтонким рамкам размером всего 1,05 мм соотношение площади экрана к поверхности фронтальной панели корпуса составляет 94 %.
На тыльной панели корпуса смартфона размещена тройная камера с поддержкой ИИ, включающая основной 50-Мп сенсор с диафрагмой f/1.8, 2-Мп датчик для измерения глубины резкости (f/2.4) и 2-Мп датчик для макросъёмки (f/2.4). Разрешение фронтальной камеры равно 8-Мп (f/2.0). Основная камера поддерживает ночной режим. Есть также режим «Двойной вид» для съемки с фронтальной и основной камер, обеспечивающий одновременное отображение на экране видео с фронтальной и основной камер. Режим непрерывной съёмки обеспечивает возможность переключения между фронтальной и основной камерами без остановки записи видео.
Батарея ёмкостью 5000 мА·ч с поддержкой быстрой зарядки SuperCharge мощностью 40 Вт гарантирует автономную работу в течение до 34 часов в режиме голосовых вызовов, до 15 часов просмотра потоковых видео, до 12 часов игр и просмотра коротких видеороликов или до 418 часов в режиме ожидания. При зарядке безопасность обеспечивается благодаря 22-уровневой системе, которая ограничивает скачки температуры батареи и напряжения.
Спецификации смартфона также включают боковой сканер отпечатков, адаптеры беспроводной связи Wi-Fi 802.11a/b/g/n/ac (2,4 ГГц и 5 ГГц) и Bluetooth 5.0, порт USB Type-C и 3,5-мм аудиоразъём. Размеры nova Y90 равны 163,3 × 74,7 × 8,4 мм, вес — 195 г. Смартфон работает под управлением EMUI 12. Устройство доступно в синем (Crystal Blue), белом (Pearl White), зелёном (Emerald Green) и чёрном (Midnight Black) цвете.